পণ্য

একটি মানুষের অন্ত্রের সিম্বিয়ন্টে আলফা-ম্যাননোসিডেসের একটি Ca2+-নির্ভর পরিবারের যান্ত্রিক অন্তর্দৃষ্টি।

কোলোনিক ব্যাকটেরিয়া, ব্যাকটেরয়েড থেটাইওটাওমিক্রন দ্বারা উদাহরণ, খাদ্যতালিকাগত পলিস্যাকারাইড এবং হোস্ট গ্লাইকানগুলিকে পুষ্টি হিসাবে কাজে লাগানোর জন্য গ্লাইকোসাইড হাইড্রোলেস (GHs) এর বৃহৎ পরিবারগুলিকে কাজে লাগিয়ে মানব স্বাস্থ্য বজায় রাখতে গুরুত্বপূর্ণ ভূমিকা পালন করে।এই ধরনের GH পরিবার সম্প্রসারণের উদাহরণ B. thetaiotaomicron জিনোম দ্বারা এনকোড করা 23 পরিবারের GH92 গ্লাইকোসিডেস দ্বারা।এখানে আমরা দেখাই যে এগুলি হল আলফা-ম্যাননোসিডেস যা হোস্ট এন-গ্লাইকান ব্যবহার করার জন্য একক স্থানচ্যুতি প্রক্রিয়ার মাধ্যমে কাজ করে।দুটি GH92 mannosidases-এর ত্রি-মাত্রিক গঠন দুই-ডোমেন প্রোটিনের একটি পরিবারকে সংজ্ঞায়িত করে যেখানে অনুঘটক কেন্দ্রটি ডোমেন ইন্টারফেসে অবস্থিত, একটি Ca(2+)-তে অ্যাসিড (গ্লুটামেট) এবং বেস (অ্যাসপার্টেট) সহায়তা প্রদান করে। নির্ভরশীল পদ্ধতি।ইনহিবিটর সহ জটিল GH92s-এর ত্রি-মাত্রিক কাঠামো ক্যাটালাইসিসের নির্দিষ্টতা, প্রক্রিয়া এবং গঠনমূলক ভ্রমণপথের অন্তর্দৃষ্টি প্রদান করে।Ca(2+) ম্যানোসাইডকে তার স্থল-অবস্থা (4)C(1) চেয়ার কনফর্মেশন থেকে ট্রানজিশন স্টেটের দিকে বিকৃত করতে সাহায্য করার ক্ষেত্রে একটি মূল অনুঘটক ভূমিকা পালন করে। (বিবলিওগ্রাফি: ন্যাট।কেম।বায়োল6, 125-32, (2010)

একটি কনকানাভালিন এ-সেফারোজ কলামে ওভালবুমিন গ্লাইকোস্পারাজিনসের ফ্রন্টাল অ্যাফিনিটি ক্রোমাটোগ্রাফি।লেকটিনের বাঁধাই নির্দিষ্টতার একটি পরিমাণগত অধ্যয়ন।

ওভালবুমিন থেকে প্রাপ্ত 10টি গ্লাইকোস্পারাগিনের সাথে সেফারোজ 4B-ইমোবিলাইজড কনকানাভালিন A (ConA) এর মিথস্ক্রিয়া ফ্রন্টাল অ্যাফিনিটি ক্রোমাটোগ্রাফি দ্বারা পরিমাণগতভাবে তদন্ত করা হয়েছিল।এই পদ্ধতিতে, একটি কার্বোহাইড্রেট দ্রবণ একটি ConA-Sepharose কলামে ক্রমাগত প্রয়োগ করা হয় এবং ইলিউশন ফ্রন্টের প্রতিবন্ধকতা মিথস্ক্রিয়া শক্তির একটি প্যারামিটার হিসাবে পরিমাপ করা হয়।ConA-এর সাথে প্রতিটি স্যাকারাইডের বিয়োজন ধ্রুবক (Kd) নির্ধারণ করা যেতে পারে।পি-নাইট্রোফেনাইল-আলফা, ডি-ম্যানোসাইডের বাঁধাইয়ের বিশ্লেষণে দেখা গেছে যে Sepharose 4B-তে স্থির হওয়ার পরে ConA-এর বাঁধাইয়ের বৈশিষ্ট্যগুলি মূলত পরিবর্তিত হয় না।প্রতিটি ওভালবুমিন গ্লাইকোস্পারাজিন বিশ্লেষণের জন্য হ্রাসকারী মেথিলেশন পদ্ধতি দ্বারা ট্রিটিয়াম দিয়ে লেবেল করা হয়েছিল।প্রাপ্ত Kd মানগুলির একটি তুলনা দেখায় যে গ্লাইকোসিল চেইনের খুব সামান্য কাঠামোগত পার্থক্যের সাথে ConA এর বাঁধন যথেষ্ট পরিবর্তিত হয়।ফলাফলগুলি পরামর্শ দেয় যে ConA একটি নির্দিষ্ট গ্লাইকোসিল চেইন গঠনকে স্বীকৃতি দেয়, ম্যান আলফা 1-6(ম্যান আলফা 1-3)ম্যান, যেখানে C-6-সংযুক্ত ম্যাননোসের C-3 অবস্থানে কমপক্ষে একটি হাইড্রক্সিল গ্রুপ মুক্ত হওয়া উচিত।