পণ্য

প্রোটিম-ওয়াইড ফসফোরিলেশন ইভেন্টগুলির বিশ্লেষণ প্রোটিন ফসফোরিলেশন নেটওয়ার্কগুলির বিশাল জটিলতার কারণে এখনও একটি বড় বিশ্লেষণাত্মক চ্যালেঞ্জ।এই কাজে, আমরা ফসফোপ্রোটোমের বিশ্বব্যাপী বিশ্লেষণে অবদান রাখার ক্ষমতার বিষয়ে Lys-N, Lys-C এবং ট্রিপসিনের পরিপূরকতা মূল্যায়ন করি।লো-পিএইচ শক্তিশালী ক্যাটেশন এক্সচেঞ্জের একটি পরিমার্জিত সংস্করণ এন-টার্মিনাললি অ্যাসিটাইলেটেড, ফসফরিলেটেড এবং অ-পরিবর্তিত পেপটাইডগুলিকে দক্ষতার সাথে আলাদা করতে ব্যবহৃত হয়েছিল।তিনটি এনজাইমের সংমিশ্রণ ব্যবহার করে মোট 5036টি অপ্রয়োজনীয় ফসফোপেপটাইডকে 1 মিলিগ্রাম প্রোটিন থেকে <1% এর মিথ্যা আবিষ্কারের হার দিয়ে চিহ্নিত করা যেতে পারে।আমাদের ডেটা প্রকাশ করেছে যে বিভিন্ন প্রোটিসের সাথে উত্পন্ন ফসফোপেপটাইড ডেটা সেটগুলির মধ্যে ওভারল্যাপটি প্রান্তিক ছিল, যেখানে দুটি একইভাবে উত্পন্ন ট্রিপটিক ডেটা সেটগুলির মধ্যে ওভারল্যাপ কমপক্ষে 4 গুণ বেশি পাওয়া গেছে।এইভাবে, Lys-N এবং ট্রিপসিনের সমান্তরাল ব্যবহার ডি-এর সাথে ট্রাইপসিনের তুলনায় শনাক্ত ফসফোপেপটাইডের সংখ্যায় 72% বৃদ্ধি সক্ষম করেছে, যেখানে ট্রিপসিনের প্রতিলিপি পরীক্ষা শুধুমাত্র 25% বৃদ্ধির দিকে পরিচালিত করেছে।এইভাবে, শুধুমাত্র ট্রিপসিন এবং লাইস-এন ডেটাতে ফোকাস করার সময়, আমরা 4671টি অপ্রয়োজনীয় ফসফোপেপটাইড সনাক্ত করেছি।সনাক্ত করা সাইটগুলির আরও বিশ্লেষণে দেখা গেছে যে Lys-N এবং ট্রিপসিন ডেটা সেটগুলি উল্লেখযোগ্যভাবে বিভিন্ন ফসফোরিলেশন মোটিফগুলিতে সমৃদ্ধ হয়েছিল, আরও প্রমাণ করে যে ফসফোপ্রোটোম বিশ্লেষণে মাল্টিপ্রোটেজ পদ্ধতিগুলি অত্যন্ত মূল্যবান।